Buenas.
Te comento lo que me pasa a mí cuando conecto un HD externo por USB a la PS3, apor si tuviera algo que ver.
Resulta que, como tengo mogollón de archivos, pues en una primera "visita" no me aparece el listado completo. De hecho, algunas carpetas me aparecen vacías.
Solo tengo que esperar un par de minutos y ya me aparece el listado completo.
Puede ser que sea algo similar.
Saludos y suerte.