Vayamos por partes
2.5 o 3.5 -> Esto depende el tamaño del disco duro, los normales de toda la vida son de 3.5, y los de portatil o mas pequeños son 2.5, asi que compra una caja acorde con el factor de forma de tu HDD.
Despues no dices nada del disco duro que le vas a conectar.Basicamente hay dos tipos IDE o SATA, mira un extraible que acepte dicha conexion.
Por ultimo, las cajas tienen multiples conexiones al exterior, minimante USB, si tu placa tiene sata te podrias plantear cojer una caja con e-Sata porque la ganancia en velocidad es bastante superior pero vamos esto ya es sobre gustos.
Y para acabar.Marcas.La verdad es que yo tenia una caja ICYBOX que iba bastante bien, aunque ya no la tengo, me busque un server NAS.En principio no creo que haya mucha diferencia entre las cajas a nivel de rendimiento, piensa si van sobre USB 2.0 dada la limitacion de ancho de banda del mismo pues no notaras mucho la diferencia, y si es e-Sata pues tampoco (este tiene muchismo mas ancho de banda).
Un saludete.
Espere haberte ayudado.