hola, sin entrar en muchos tecnicismos, SÍ que hay diferencia.
El central reproduce +/- el mismo rango de frecuencias que los frontales, dado que se lleva todas las conversaciones interesa que sea de calidad y si se puede, de la misma marca y serie que los frontales, para que suene el trío armonizado.
el Subwoofer reproduce sólo las frecuencias más bajas, como un terremoto o temblor o un motor arrancando. no tiene que ser de la misma marca que los frontales y además lo puedes colocar (en el suelo) casi en cualquier sitio. tiene una construcción distinta de los altavoces normales.
en el foro hay mucha más información.
saludos,