El yaDis no está pensado para tener más de uno, hay maneras de lograrlo pero son bastante complejas, hace bastante tiempo en este mismo hilo alguien comentó como hacerlo, guardando el workspace temporalmente de manera que tuviera varios y utilizar el adecuado antes de abrir el yadis.
Lo utilizaban para tener muchos discos externos, cada uno con su yadis.
En tu caso me parece innecesario, si quieres separar las películas de los dos discos te basta con crear una selección y asignar cada peli a la selección correspondiente. Las selecciones aparecen en el menu inicial del yadis junto a películas y series. Yo por ejemplo tengo una de infantil, otra de conciertos y otra de no visto.
Creo que eso se adapta bien a lo que quieres y es bastante más sencillo. Además tienes la opción de asignar automáticamente cualquier película nueva a una selección, ideal por ejemplo para las no vistas.
Bueno puede que la mayoría esté disfrutando de las vacaciones y haya desconectado de la tecnología un poco.
Saludos.