Cuando dices que no reconoce... te refieres a que no se oye sonido?
Por lo que he entendido tienes: PC conectado directamente a TV por cable de VGA (D-Sub15) y el PC conectado al Onkyo por HDMI??
Porque no conectas la salida de HDMI del AVR a una entrada HDMI de la TV? Igual así se solventa...
Si no oyes sonido de salida del PC suele ser, en la mayoría de casos problema de drivers y configuración del HDMI Out.
Dinos que tarjeta de video y sistema tienes
Saludos