Las conexiones HDMI de entrada en la barra son para lectores BR/DVD o Mediacenters, para enviarle audio (junto al video que a su vez remitirá al TV).
La salida HDMI de tu barra Yamaha tiene posibilidad de retorno de audio (ARC), puede recibir señal de audio desde el TV (si este tiene conexión de entrada HDMI 1.4 también con ARC), por el mismo cable HDMI que usarías para enviar la imagen que le llega a la barra, desde cualquiera de las fuentes, al TV.
Si no usas ninguna fuente, salvo el sonido del TV, no precisas añadir más cables, si usas otras fuentes debes conectarlas a la barra por HDMI (si usas otras fuentes y las conectar directamente al TV, lo probable es que la señal que salga por la conexión óptica no sea 5.1, si no PCM estéreo), y otro HDMI al TV, si este tiene HDMI 1.4 con ARC entonces no necesitas el cable óptico.
Aunque parezca lioso, leyendolo poco a poco se entiende, espero.