Amig@ manuolle, este "fallo" que comentas (que no es tal) depende de si en el archivo que estás reproduciendo están o no incluidos los conocidos como "subtítulos forzados" y si los tienes o no seleccionados desde el menú de subtítulos.
No se si habrás observado que hay películas en las que cuando entras a ver las pistas de subtítulos desde el menú te encuentras con que aparecen dos de ellas marcadas como "Español" pues uno de esos dos suelen ser los "forzados" que si lo habilitas solo aparecerán cuando se habla en un idioma que no es el de la pista de audio seleccionada.
Lo mejor es, cuando descargues una película, observar si esta incluye subtítulos forzados o no, para tenerlo en cuenta y habilitarlos desde el menú.
Resumiendo, para ver los subtítulos solo en partes donde no se habla en español, tienen que darse dos condiciones:
1. Que estén incluidos los "subtítulos forzados" en el contenedor de la película (sea mkv,iso...)
2. Que tengas seleccionada dicha pista en el menú de subtítulos para que la reproduzca llegado el momento.
No se si habré sido capaz de explicartelo con suficiente claridad, si no, aquí me tienes.